到了老窝后，他马上遣使送信给张士诚，约定共灭朱元璋。张士诚只想自固，没有应承。
在江州修整了数日，陈友谅引大军东下，直扑建康。
金陵城中，人心大骇，朱元璋手下不少人心意摇动，有欲降的，有欲逃的，有欲据钟山死守的，人心惶惶。
朱元璋问计于刘基。刘基心沉气稳，说：“天道后举者胜。我军以逸待劳，何患不克！明公您宜开府库，固士心，倾至诚，伏兵伺陈击敌。取威制胜，以成王业，在此一举。”
朱元璋遂意决。
当是时也，朱元璋文臣武将中多有出迎自保之心，估计连朱元璋本人也多夜睡不着觉，细想过是否当个“汉臣”。正是刘基一席话，终使朱元璋心稳神固。
刘基于1360年春与宋濂、章溢、叶琛三人一起往建康投附朱元璋，此人精通天文、兵法，是个通才人物，很是有真本事。更引人注目的是，他乃元朝进士出身（元朝汉人中举者，百年间仅两千人左右，极其稀罕）。
这时，有人提议朱元璋先收复太平以牵制敌方，有人建议朱元璋自己亲自指挥出建康御敌，均为朱元璋所拒。朱元璋没读过什么兵书，属于那种天生有感觉的军事家，他说：
“太平城壕堑深固，如果当时陈友谅没有巨舰，不能水上进攻，太平根本不会陷落。倘使我们现在去围城，不可能短时间拿下。而且，贼军水军十倍于我军，屯兵于坚城之下，进不能取，退不及援，肯定吃亏。如果我军出城逆敌，敌军以偏师牵制我们主力四处兜圈，陈友谅会以舟师顺流而下直奔建康，半日即可抵城下。到时，即使我们的步兵骑兵能够即时回援，也是百里趋战，精疲力竭，此乃兵法大忌。”
朱元璋先派出胡大海直捣广信（今江西上饶）以制其后，然后召指挥康茂才议事。康茂才乃先前降而复叛的陈野先属下将领，闻诏立至。朱元璋开门见山：“听说你一直和陈友谅关系不错，今其入寇，我很想让他快些来。你假装充当他的内应，派人捎信给他，约他速来，最好让他兵分三道来击，以弱其势。”
康茂才唯唯，仍旧有些摸不着头脑：“我家中有个门子，从前一直在陈友谅家中做事，让他送信，对方必无疑心……不过，我们如今多数人都害怕汉军到来，为何要引诱对方来打我们？”
朱元璋一笑：“情况再发展下去，陈友谅必和张士诚联手，二寇谋合，何以对付！今先破陈贼，则张士诚闻之胆落！”
康茂才恍然，依计行事。
康茂才的门子化装进入陈友谅军，陈得书大喜，问：“康公今何在？”
门子答：“正提军守护江东桥。”
问：“桥是何质地？”
答：“木桥。”
陈友谅喜形于色：“你回去告诉康公，我很快就去那里，到达后则高呼‘老康’，让他闻呼而出。”
门子回来后，康茂才马上报知朱元璋。朱元璋大喜：“贼人入套了！”忙命李善长派人把江东桥木板拆掉，改成铁石桥。一夜之间，桥成。
同时，听说陈友谅一军打探过新河口方面的道路，朱元璋派大将赵德胜在新河两岸筑虎口新城。
于是，朱元璋动员所有人马，命常遇春、冯胜等人率精兵三万埋伏于石灰山侧，徐达等人陈兵于建康南门外，杨璟驻兵大胜港，张德胜等人率水军出龙江关外，朱元璋本人亲统大军在卢龙山待敌。
他命令持旗信号兵分持红黄旗埋伏于卢龙山左右，“寇至，则举红旗；黄旗举，则伏兵皆发”。
陈友谅自恃有康茂才做内应，人马船只又多，果然引水军浩浩荡荡杀来，直进大胜港。
港湾窄狭，又有朱元璋大将杨璟严阵以待，每拨只能有三船并进，急得陈友谅跳脚，也不想分兵了。他马上从大胜港掉头，出长江之上，径直扬帆趋江东桥。
结果，船队大集出发，巨船大舟，本想一下子撞毁木桥直行，近前却发现桥身是大石砌成，绕以铁环，灌以铁汁。
陈友谅大惊，忙急呼，希望“内线”康茂才出来接应。喊了半天，根本没人应声，陈友谅忽悟自己中计。
迂回半日，费了好大的劲，陈友谅只能下令舰队再次掉头，直趋龙江。汉军势锐，他们绕了半天道，却都是待在船上，体力并未消耗。靠岸后，一万多精兵飞身下船，在滩头立栅，准备结阵进攻。
身在卢龙山的朱元璋看得仔细，下令击鼓举旗。红旗扬起，诸军争相趋前拔栅，与陈友谅汉军厮杀在一起。正相持间，又一轮鼓声响起，山前黄旗又起，常遇春伏兵忽现，徐达率部杀至，张德胜的水师也一时云集。
内外合击之下，陈友谅登岸的兵士根本招架不住，争相往岸边的船上跑。恰值退潮，无数巨舰搁浅，汉兵被杀掉、溺毙无数，仅被俘虏的就有近万人，又有巨舰百余艘、战船数百皆为朱元璋所得。
坐在指挥大舟上的陈友谅见势不妙，忙乘小船逃走。朱元璋没有鸣金收军，下令诸将急追。追至采石矶，陈友谅纠结溃亡之众，复与朱元璋军大战，复被廖永忠、华云龙等人打得大败。
朱元璋军队乘胜之下，吓得陈友谅太平守军也无斗志，慌忙遁去。朱元璋收复了太平城。
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